Homeworld: Deserts of Kharak

События в игре разворачиваются за 106 лет до тех, что происходили в оригинальной игре "Homeworld" (1999). Местом действия здесь служит высыхающая планета Кхарак, где орбитальным спутником обнаруживается некая крупная аномалия, таящее в себе загадочный объект "Джараси", который по убеждению ученых из Северной Коалиции должен спасти от вымирания человечество, так как есть шанс отправиться на другую планету. Для этой спасательной миссии сооружается целая экспедиция из пяти авианосцев, но в конечном счете из них в строю останутся лишь двое, и уцелевшим остаткам Северной Коалиции придется дать бой местным кочевникам-гаалсиенам, под предводительством фанатика К`Хад Саджуука, вознамерившемуся всячески помешать им добраться до места назначения.